Ted: You all want green peppers on your pizza right? We’ll have two large pizzas with green peppers.
Steve: I hate green peppers!
Fred: Don’t rock the boat, Steve! Everyone else loves them.

Rocking the boat means making trouble for the group. If one person in a boat moves around, it makes the boat rock, and that affects all the other people riding in the boat.

テッド:みんな、ピーマンがのったピザでいいよね?ピーマンがのったLサイズのピザを2枚お願いします。
スティーブ:僕、ピーマン嫌い。
フレッド:そう言うなよ、スティーブ!ほかの皆は好きなんだから!

船を揺るがすことは他のメンバーに迷惑をかけることです。小舟に乗っている乗員の一人が動き回ると、船が揺れて、他の乗員みんなに影響します。